ميكروببتيد
الميكروببتيد (بالإنجليزية: Micropeptide) ويُعرف كذلك باسم الميكروبروتين، هو عديد ببتيد طوله أقل من 100-150 حمض أميني يُشفر من إطارات قراءة مفتوحة قصيرة (sORFs).[1][2][3] وفي هذا السياق، هو مختلف عن الكثير من الببتيدات الصغيرة النشطة الأخرى التي تنتج من قصٍ لبروتينات كبيرة أثناء تعديلات ما بعد الترجمة.[1][4] من حيث الطول، الميكروبيبتيدات أقصر من البروتينات «المعيارية» التي متوسط طولها 330 في بدائيات النوى و449 في حقيقيات النوى.[5] تسمى الميكروببتيدات أحيانا حسب موضعها الجينومي، على سبيل المثال: ناتج النسخ من إطار قراءة مفتوح عكس الاتجاه [الإنجليزية] (uORF) يمكن أن يُسمى: الببتيد المشفر من uORF (uPEP).[6] لا تملك الميكروببتيدات تسلسلات تأشير في النهاية الأمينية، وهذا يوحي بأنها على الأرجح ستتموقع في السيتوبلازم.[1] لكن تم العثور على بعض الميكروببتيدات في أحياز خلوية أخرى، كما يوحي به تواجد ميكروببتيدات عبر غشائية.[7][8] وهي موجودة لدى كلٍ من حقيقيات وبدائيات النوى.[1][9][10]
إطارات القراءة المفتوحة الصغيرة التي تُترجم منها الميكروببتيدات يمكن أن تتواجد في المناطق 5' غير المترجمة (5'UTRs)، الجينات الصغيرة، الرنا الرسول عديد السيسترون. بعض الجينات المشفرة للميكروببتيدات تم توصيفها خطأً في البداية على أنها رنا غير مشفر طويل (lncRNA).[11]
نظرا لطولها الصغير، تم تجاهل الـsORFs، لكن تم تحديد مئات الآلاف من الميكروببتيدات المفترضة عبر عدة تقنيات في العديد من الكائنات. جزء صغير فقط من إطارات القراءة الصغيرة هذه التي تملك قابلية للترجمة تم تأكيد التعبير عنها وعن امتلاك الميكروببتيدات الناتجة منها لوظيفة. الميكروببتيدات التي تم تحديد وظائفها، تقوم في العموم بأدوارٍ في التأشير الخلوي، تخلق الأعضاء والفيسيولوجيا الخلوية. مع اكتشاف المزيد من الميكروببتيدات يتم اكتشاف وظائفها كذلك. أحد وظائفها التنظيمية هي عملها كمفتاح ببتيدي يقوم بمنع التعبير عن التسلسلات المشفرة مع الاتجاه بتعطيل الريبوسومات عبر تنشيطها المباشر أو غير المباشر بواسطة جزيئات صغيرة.[11]
مراجع[عدل]
- ^ ا ب ج د Crappé J، Van Criekinge W، Menschaert G (2014). "Little things make big things happen: A summary of micropeptide encoding genes". EuPA Open Proteomics. ج. 3: 128–137. DOI:10.1016/j.euprot.2014.02.006.
- ^ Makarewich CA، Olson EN (سبتمبر 2017). "Mining for Micropeptides". Trends in Cell Biology. ج. 27 ع. 9: 685–696. DOI:10.1016/j.tcb.2017.04.006. PMC:5565689. PMID:28528987.
- ^ Guillén G، Díaz-Camino C، Loyola-Torres CA، Aparicio-Fabre R، Hernández-López A، Díaz-Sánchez M، Sanchez F (2013). "Detailed analysis of putative genes encoding small proteins in legume genomes". Frontiers in Plant Science. ج. 4: 208. DOI:10.3389/fpls.2013.00208. PMC:3687714. PMID:23802007.
{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link) - ^ Hashimoto Y، Kondo T، Kageyama Y (يونيو 2008). "Lilliputians get into the limelight: novel class of small peptide genes in morphogenesis". Development, Growth & Differentiation. 50 Suppl 1: S269–76. DOI:10.1111/j.1440-169x.2008.00994.x. PMID:18459982.
- ^ Zhang J (مارس 2000). "Protein-length distributions for the three domains of life". Trends in Genetics. ج. 16 ع. 3: 107–9. DOI:10.1016/s0168-9525(99)01922-8. PMID:10689349.
- ^ Rothnagel J، Menschaert G (مايو 2018). "Short Open Reading Frames and Their Encoded Peptides". Proteomics. ج. 18 ع. 10: e1700035. DOI:10.1002/pmic.201700035. PMID:29691985.
- ^ Anderson DM، Anderson KM، Chang CL، Makarewich CA، Nelson BR، McAnally JR، Kasaragod P، Shelton JM، Liou J، Bassel-Duby R، Olson EN (فبراير 2015). "A micropeptide encoded by a putative long noncoding RNA regulates muscle performance". Cell. ج. 160 ع. 4: 595–606. DOI:10.1016/j.cell.2015.01.009. PMC:4356254. PMID:25640239.
- ^ Bi P، Ramirez-Martinez A، Li H، Cannavino J، McAnally JR، Shelton JM، Sánchez-Ortiz E، Bassel-Duby R، Olson EN (أبريل 2017). "Control of muscle formation by the fusogenic micropeptide myomixer". Science. ج. 356 ع. 6335: 323–327. Bibcode:2017Sci...356..323B. DOI:10.1126/science.aam9361. PMC:5502127. PMID:28386024.
- ^ Alix E، Blanc-Potard AB (فبراير 2008). "Peptide-assisted degradation of the Salmonella MgtC virulence factor". The EMBO Journal. ج. 27 ع. 3: 546–57. DOI:10.1038/sj.emboj.7601983. PMC:2241655. PMID:18200043.
- ^ Burkholder WF، Kurtser I، Grossman AD (يناير 2001). "Replication initiation proteins regulate a developmental checkpoint in Bacillus subtilis". Cell. ج. 104 ع. 2: 269–79. DOI:10.1016/s0092-8674(01)00211-2. hdl:1721.1/83916. PMID:11207367. S2CID:15048130.
- ^ ا ب Andrews SJ، Rothnagel JA (مارس 2014). "Emerging evidence for functional peptides encoded by short open reading frames". Nature Reviews. Genetics. ج. 15 ع. 3: 193–204. DOI:10.1038/nrg3520. PMID:24514441. S2CID:22543778.
